深淵和世紀(jì)系統(tǒng)，彼此對立，是這個多元宇宙誕生時就誕生了的，目前為止整個多元宇宙最高位的存在。

    世紀(jì)系統(tǒng)，相對于深淵，是類似于“有”的概念的代表一般的存在。它的使命是讓這個多元宇宙維持著正常的存在——換而言之，就是保持世界本身的存在。最初，世紀(jì)系統(tǒng)以自身介入世界，對抗深淵的入侵，效果卓著，但也有對于虛空影響較大等弊端，以及系統(tǒng)本身受損，導(dǎo)致多元宇宙直接崩解的風(fēng)險。

    隨著時間的推移，深淵入侵的規(guī)模不斷地擴(kuò)大，同時虛空之中孕育出的世界也越來越多，世紀(jì)系統(tǒng)分身乏術(shù)，出于這一原因，以及自身安全的需要，它設(shè)置了“code”這一代行者職位，通過將無數(shù)世界劃分進(jìn)大量的彼此區(qū)分，但也有重疊部分的分區(qū)之中，交由code來代行系統(tǒng)的行動。

    世紀(jì)系統(tǒng)內(nèi)部運(yùn)營有足以維持code生活和休息的各個區(qū)域，但是似乎是出于安全性的考慮，在系統(tǒng)內(nèi)部，code無法會面和交互。

    世紀(jì)系統(tǒng)為每個code提供必要的量產(chǎn)型裝置、技術(shù)，訓(xùn)練設(shè)施和格納空間，以及改造和建造服務(wù)，并且將code自己獲得的技術(shù)加持成在所有世界都能通用的，獨(dú)立于世界的科技樹。在code滿足特定條件的情況下，還可以為code提供名為“領(lǐng)地”的獨(dú)立后勤世界。領(lǐng)地在世紀(jì)系統(tǒng)的完全保護(hù)下，永遠(yuǎn)不會受到深淵的威脅，但是作為交換，則需要盡力支持code的行動。

    據(jù)說世紀(jì)系統(tǒng)本身并不關(guān)心世界內(nèi)部是和平還是戰(zhàn)爭等狀態(tài)，是一個冷漠武器的家伙，但是隨著時間的推移，最近越來越像是一個普通的、有感性的意識了，因此越來越受到了code們的好感。也因為如此，世紀(jì)系統(tǒng)最近似乎偶爾會做出一些出格的舉動。

    根據(jù)code任務(wù)結(jié)束后根據(jù)世界線變動水平來提高獎勵的現(xiàn)象來看，也許世紀(jì)系統(tǒng)的能量來源是世界之間距離變化或是世界本身變化又或者是世界線變動而從無盡虛空中得到的能量也說不定。

    深淵，也是誕生自多元宇宙誕生的那一刻的存在，但是相對于世紀(jì)系統(tǒng)，它似乎是混亂、邪惡且充滿了破壞欲望和傾向的家伙——甚至于這玩意究竟能不能算生物也是個謎。它們平時完全無法觀測（但是世紀(jì)系統(tǒng)似乎有模糊的感知能力，從而針對性的前往世界與之對抗），但是當(dāng)它們想要侵蝕和破壞世界，卻必須依附在一個實體上才能開始。

    以往的code一直沒有找到深淵的活動模式，但最近新晉的機(jī)戰(zhàn)區(qū)code似乎對此有所發(fā)現(xiàn)。

    深淵首先會寄生于世界內(nèi)某實體，其總數(shù)一般為一個，大多數(shù)情況下，進(jìn)行侵蝕的深淵數(shù)量都是一到三個。它們會傾向于寄生在有野心或是破壞欲望又或者是其他什么負(fù)面情緒，同時又可以為之采取任何行動的個體身上。它們會強(qiáng)化宿主的這一傾向，但此時宿主依然抱有意識，深淵本身也處于沒有活性的狀態(tài)。有少數(shù)報告表示深淵也會寄生于非生命體，并且在接觸到合適的生命體個體之后轉(zhuǎn)移到其身上。

    在經(jīng)過一段時間的寄生潛伏后，深淵會真正的活性化——這一般需要一個契機(jī)，常見的是宿主的惡性欲望高度爆發(fā)——它會化為蠕動的黑色不明物質(zhì)，將它所觸及的所有東西都化為這種物質(zhì)。此時其宿主將失去意識，僅保留大體的形體。

    由于不明的原因，它在侵蝕任何有破壞力的裝置（譬如艦船、ms）后，依然會保留其大致形態(tài)，并利用（或是擬態(tài)？）其原有武器進(jìn)行攻擊——這一情況下此裝置的防護(hù)力和破壞力都將有著飛躍性的提升。

    然而，實體化的深淵是目前可見唯一有效的可被攻擊的狀態(tài)，因此世紀(jì)系統(tǒng)和code主要對抗的也是這一形態(tài)的深淵。由于深淵感染體的高強(qiáng)度和高破壞力，一般用于對抗深淵的武力也是高度精英化的。

    深淵在這一階段后，將會開始快速的擴(kuò)張階段，當(dāng)世界的物質(zhì)被侵蝕率達(dá)到一定水平后，似乎有可能導(dǎo)致code與系統(tǒng)之間的聯(lián)系斷開；隨著侵蝕率進(jìn)一步提高，很快就會達(dá)到“世紀(jì)系統(tǒng)判定難以挽救或者無法挽救”的狀態(tài)，也就是“淪陷區(qū)”。

    當(dāng)侵蝕率達(dá)到100%后，世界似乎會在更高層面上開始受到破壞。這一狀態(tài)的世界是完全沒有可能修復(fù)的，因此世紀(jì)系統(tǒng)會動用自己的力量將這樣的世界直接從根本上毀滅——這同時也是毀滅一個世界內(nèi)的深淵的最終手段。

    有猜測表示深淵退行會侵蝕前物質(zhì)是可行的，但是目前為止還沒有成功的研究成果；也有猜測表示深淵有可能可以成為與世紀(jì)系統(tǒng)不再對立的無害存在，但由于該提案過于危險，且難度過高，目前為止沒有進(jìn)行過任何的相關(guān)研究和試驗。